Алтынемел биосфералық резерватының аумағы географиялық тұрғыдан Іле тауларының бассейнінің орталық бөлігінде орналасқан, солтүстігінен Алтынемел, Матай, Дегерес, Шолақ таулары орналасқан. Саябақтың оңтүстік табиғи шекарасы - Іле өзені мен Қапшағай су қоймасы. Табиғи-географиялық аудандастыруға сәйкес саябақ аумағы Іле-Балқаш-Алакөл шөлді ойпатының Іле шөлейт аймағының бөлігі болып табылады. «Алтынемел» өз территориясы бойынша Қазақстанның барлық қорғалатын табиғи аумақтарының арасында өте үлкен, бұл аймақтың биологиялық әртүрлілігін сақтау үшін өте маңызды. Қорық териологиялық, орнитологиялық және сулы-батпақты алқап ретінде құрылды, оның басты мақсаты бірінші кезекте тұяқтылардың мекендейтін ең маңызды және ерекше жерлерін, сонымен қатар Іле өзенінің алқабы мен Қапшағай су қоймасының жағалауларындағы шоғырланған құстардың ұя салуын және су құстарын сақтау болды. Сонымен бірге саябақтың негізгі мақсаттары мен міндеттерінің бірі - рекреациялық және туристік шараларды жүзеге асыру.
Алтынемел биосфералық қорығының жалпы ауданы 535 909,4 га құрайды. Негізгі аймақтың ауданы 54 767,5 га, буферлік аймақ - 252 885,8 га, өтпелі аймақ - шамамен 228 256,1 га. Барлық аймақтар Алтынемел мемлекеттік ұлттық табиғи паркінің аумағына сәйкес келеді.
Биосфералық резерваттың негізгі аймағы - Алтынемел мемлекеттік ұлттық табиғи паркінің ерекше қорғалатын табиғи аумағы, негізгі аймақтың ауданы 7 76 бөліктен тұратын 54 767,5 га. Биосфералық резерваттың биіктік шегі 1000-2290 м аралығында өзгереді.
«Ерекше қорғалатын табиғи аумақтар туралы» Қазақстан Республикасы Заңының 8-тарауының 44-бабында ұлттық табиғи парк туралы нақты анықтама берілген: Мемлекеттік ұлттық табиғи парк - ерекше экологиялық, ғылыми, тарихи, мәдени және рекреациялық маңызы бар табиғатты қорғау, экологиялық білім беру, ғылыми, туристік және рекреациялық мақсаттар үшін бірегей табиғи кешендер мен мемлекеттік табиғи резерваттар қорының объектілерін пайдалану; биологиялық және ландшафтық әртүрлілікті сақтауға арналған экологиялық және ғылыми мекеме мәртебесі бар ерекше қорғалатын табиғи аймақ. Сол заңның 45-бабының 2-тармағына сәйкес: «Қорықтық тәртіп ай мағында кез-келген шаруашылық қызметке және мемлекеттік ұлттық табиғи парктің аумағын рекреациялық пайдалануға тиым салынады және мемлекеттік табиғи қорық режимінің түріне сәйкес қорғалатын резервтік тәртіп белгіленеді».
Буферлік аймақ. «Ерекше қорғалатын табиғи аумақтар туралы» Қазақстан Республикасы Заңының 45-бабының 1-тармағына сәйкес «Алтынемел» биосфералық резерватының буферлік аймағында 3 аймақ бар: б) туристік және рекреациялық қызмет аймағы; в) шектеулі шаруашылық қызмет аймағы, сондай-ақ ұлттық парктің периметрі бойынша 2-3 км болатын арнайы құрылған қорғаныс жолағы. Буферлік аймақтың ауданы 252 855,8 га.
Өтпелі аймақ. Алтынемел биосфералық резерватының өтпелі аймағы (даму аймағы, ынтымақтастық) Алматы облысының Кербұлақ және Панфилов әкімшілік аудандарының аумағында орналасқан. Өтпелі аймақтың жер учаскесінің жалпы ауданы шамамен 228 256,1 га құрайды.
Негізінен пайдаланылатын жерлер жайылымдарға, басқа жерлерге бөлінеді, бірақ шабындық жерлер азырақ. Шаруа қожалықтары негізінен ұсақ және ірі мүйізді малдарды бағуда, дәнді дақылдар (арпа, жүгері, күнбағыс және т.б.) аз мөлшерде өсіріледі. Мал жайылатын жерлерде бірнеше ондаған шопандар қашарлары бар, олар негізінен мал ұстауға арналған. Қорық аумағындағы жол инфрақұрылымы негізінен ұзындығы 450 км болатын кордондар арасындағы топырақты жолдармен сипатталады. Елді мекендердің жерлерінде Басши кентін елді мекендермен - Нұрым және Аралтөбе ауылдарымен байланыстыратын қоғамдық асфальт жол бар. Қорықтың орталық ғимараты және негізгі инженерлік коммуникациялар мен ғимараттар Басши ауылында орналасқан. Басши ауылы және биосфералық резерваттың орталық ғимараты телефон байланысы, электр энергиясы, су құбыры, жергілікті канализация және жылумен қамтамасыз етілген. Қорықтың инженерлік инфрақұрылымымен қамтамасыз ету аяқталмаған, бұл көптеген электр қуатымен қамтамасыз етілмеген кордондарға қатысты. Кордондардың көп бөлігі электр энергиясына деген қажеттілікті қанағаттандыру үшін электр генераторларымен қамтамасыз етілген, тек Шыған кордонына Басши ауылынан электр желісі жүргізілген.
Табиғи-географиялық аудандастыруға сәйкес саябақ аумағы Іле-Балқаш-Алакөл шөлді ойпатының Іле шөлейт аймағының бөлігі болып табылады. «Алтынемел» территориясы Қазақстанның барлық қорғалатын аймақтарының арасында өте үлкен, бұл аймақтың биологиялық әртүрлілігін сақтау үшін өте маңызды. Резерват териологиялық, орнитологиялық және сулы-батпақты алқап ретінде құрылды, оның басты мақсаты - бірінші кезекте тұяқтылардың мекендейтін ең маңызды және ерекше жерлерін, сонымен қатар Іле өзенінің алқабы мен Қапшағай су қоймасының жағалауларындағы шоғырланған құстардың ұя салуын және су құстарын сақтау болды. Сонымен бірге саябақтың негізгі мақсаттары мен міндеттерінің бірі - рекреациялық және туристік шараларды жүзеге асыру.
Сүтқоректілер фаунасы 7 отрядтың 70 түрінен тұрады. Насекомқоректілердің 6 түрі, жарқанаттар - 11, жыртқыштар -15, тақтұяқтылар - 3, жұптұяқтылар - 7, кеміргіштер - 26 және қоянтәрізділердің - 2 түрі бар. Жалпы, бұл Қазақстандағы омыртқалылар класының фаунасының 39,2% құрайды. Жеке табиғи аймақ үшін бұл шаманы оның құрамдас фаунасының өте жоғары деңгейі деп санауға болады. Биосфералық резерваттың шекарасында орналасқан Іле ойпатының құстар фаунасында қазіргі кезде 260 түрі бар, олардың 154-і ұя салады. Қазақстан Республикасының Қызыл кітабына енгізілген сирек кездесетін және құрып кету қаупі бар құстардың Іле ойпатында 28 түрі тіркелген, оның ішінде 27 түр ұя салады. Іле ойпатындағы құстардың қысқы фаунасы 21 түрді құрайды. Қазақстанда тіркелген барлық 22 түр ұлттық парк аумағында кездеседі, 60 тұқымдастың 52 түрі саябақта тіршілік етеді, сонымен қатар Қазақстанда тіркелген құстың 214 туысының 198 туысы парк аумағында қоныстайды. Сонымен, құстардың жүйеленген топтары биосфералық резерват аумағында жоғары дәрежеде кездесетінін атап өткен жөн.
Алтынемел биосфералық резерваты аумағында қосмекенділер мен бауырымен жорғалаушылардың түр құрамы мен таралуы толығымен нақтыланды. Бүгінгі күні батрахофауна өкілдерінің 4 түрі және герпетофаунаның 25 түрі мекендейді, бұл бүкіл қазақстандық фаунаның шамамен 29% және 45% құрайды. Бауырымен жорғалаушылардың алуан түрлілігі өте көрнекті, оны қосмекенділер үшін айту мүмкін емес, бұл құйрықтылар отряды өкілдерінің болмауына байланысты. Қазақстан фаунасынан агама және кесірткелер тұқымдастарының түрлері ең толық құрамында тіршілік етеді: республикада тіркелген 8 агаманың бес түрі, кесірткелердің 6 түрі (10-дан) сарыбас жылан мен геккондардың барлық түрлерінің жартысы қарастырылып жатқан территорияда тіркелген.
Қазіргі уақытта Алтынемел биосфералық резерватының су айдынында 6 отряд 9 тұқымдас және 26 туысқа жататын сүйекті балықтардың кемінде 33 түрі мекендейді. БР ихтиофаунасының Қазақстанның бүкіл балық фаунасына қатынасы өте жоғары. Ұлттық парктің су аймағында республикадағы балық түрлерінің шамамен 1/3 немесе 31,7% -ы кездеседі. Республикада тіркелген 11 отрядтың жартысынан көбі (54,5%) қорық суларында, 19 тұқымдас және 63 туыс - 47,4% және 41,3% сәйкес. Дегенмен, дөңгелекауыздылар класына жататын жыланбалықтың жоқ екенін атап өткен жөн.
Қазіргі уақытта резерватта балықтардың, қосмекенділердің, бауырымен жорғалаушылардың, құстардың және сүтқоректілердің 42 түрі «Қызыл кітапқа» енген. Сонымен бірге мұнда «Қызыл кітапқа» енген омыртқасыз жануарлардың ондаған түрлері мекендейді. Алайда олардың саны әлі күнге дейін белгісіз және зерттеуді қажет етеді.
Геоботаникалық және экожүйелік көзқарас тұрғысынан алғанда, Қапшағай-Іле аймағы ерекше маңызға ие, өйткені ол Қазақстанның шөлді аймағында және тау ойпатында орналасқан. Ол батысында және солтүстігінде Жоңғар Алатауының оңтүстік сілемдерімен, оңтүстігінде Қапшағай су қоймасы мен Іле өзенімен шектеседі және салыстырмалы түрде кішкене аймақтағы әртүрлі ландшафттар мен экожүйелердің сирек кездесетіндігімен ерекшеленеді. Экожүйенің әртүрлілігі түрлі аймақтық және интрозональдық типтерден тұрады, мысалы: шөлдердің әртүрлі типтері, Іле өзенінің тоғайлы ормандары, жапырақты және шырша ормандары, тұзды батпақтар, сорлар және басқалар. Қапшағай таулы ойпатының өсімдік жамылғысының ерекшелігі күрт континенталды құрғақ климат аясындағы аймақтың табиғи-географиялық ерекшеліктеріне байланысты.
Ботаникалық және географиялық тұрғыдан бұл территория жоңғар және солтүстік туран шөлдерінің арасындағы өтпелі аймақта орналасқан, бұл өсімдіктердің бірегей қоғамдастықтарының және олардың үйлесулерінің (жоңғар, жоңғар-солтүстік-тұран және солтүстік-тұран) бір-бірімен байланысын түсіндіреді. Аймақта ғалымдар жоғары тамырлы өсімдіктерінің 75 тұқымдас 320 туысқа жататын 1800 түрін тіркеді. Флора құрамындағы жетекші рөлді 15 негізгі тұқымдас атқарады, олар түрлердің әртүрлілігінің негізгі бөлігі (80%) және флораның жалпы туысының 70% -нан асады. Өсімдіктің сирек кездесетін түрлерінің ішінде, оның ішінде Қазақстанның Қызыл кітабына енгізілген түрлердің 29-ы бұл аймақта нақты түрде анықталған, олардың кейбіреулері тек осы ұлттық парктің аумағында ғана кездеседі.
Сондай-ақ, биосфералық резерваттың құндылығы оның аумағында ескерткіштер мен тарихи-мәдени мұра объектілерінің орналасуымен негізделген. Олардың ішіндегі ең маңыздылары - республикалық маңызы бар «Айғай құм» ескерткіші, «Бесшатыр» сақ қорғандары, «Таңбалытас» петроглифтері және басқалар.
Сонымен, Алтынемел биосфералық резерватының экологиялық маңызы ең алдымен Жоңғар Алатауы мен Іле ойпатының флора мен фаунасын, ландшафттар мен табиғи экожүйелерін сақтау мен өсіруден тұрады. Бұған Іле ойпатының ең бағалы сулы-батпақты жерлері жатады. Экологиялық режим және резерват аумағын аймақтарға бөлу адамның шаруашылық іс-әрекетінің қорғалатын экожүйелерге зиянды әсерін азайтуға және сонымен бірге зиянсыз экологиялық туризмді белсенді дамытуға мүмкіндік береді.
«Алтынемел» биосфералық резерваты әкімшілік-аумақтық жағынан Қазақстанның оңтүстік-шығысында, Алматы облысы Кербұлақ және Панфилов аудандарының шекарасында орналасқан. Резерваттың орталық мекені Басши ауылында, аудандық орталық Сарыөзек қаласынан 90 км және облыс орталығы Талдықорған қаласынан 190 км жерде орналасқан.
Өңірдің экономикалық әлеуетін, оның ішінде туризмді дамыту үшін қолайлы табиғи және рекреациялық алғы шарттар облыстың әлеуметтік-экономикалық даму деңгейінің жеткіліксіздігімен шектеледі. Облыста ірі кәсіпорындар іс жүзінде жоқ, орта және шағын кәсіпорындар өндірістік және өндірістік емес инфрақұрылым нысандарының қанағаттанарлықсыз жағдайында болғандықтан жергілікті халықты жұмыспен қамтамасыз ете алмайды. Кербұлақ және Панфилов аудандарындағы өнеркәсіп өндірісінің негізі ауыл шаруашылығының құрылымына байланысты ауылшаруашылық өнімдерін қайта өңдеу болып табылады. Сонымен, Кербұлақ және Панфилов аудандарында ауылшаруашылық өнімінің көлемі өнеркәсіптік өндіріс көлемінен бірнеше есе көп. Бұл аймақтарда ауылшаруашылық құрылымында мал шаруашылығы басым.
Алматы облысы Статистика департаментінің мәліметтері бойынша 2011 жылдың бірінші тоқсанында Панфилов ауданында экономикалық белсенді халық саны 62416 адамды, Кербұлақ ауданында - 29 193 адамды құрады. Экономикалық белсенді халық құрамына экономикалық қызметтің барлық түрімен айналысатындар (үй шаруашылығының қосалқы учаскелерін қосқанда) және жұмыссыздар кіреді. Панфилов ауданында өзін-өзі жұмыспен қамтығандардың саны 2011 жылдың 1 тоқсанында 32344 адамды, Кербұлақ ауданында - 11688 адамды құрады. Панфилов ауданында жұмыссыздардың саны 3496 адамды, Кербұлақ ауданында - 1695 адамды құрады. 2011 жылдың бірінші тоқсанында жұмыссыздық деңгейі Панфилов ауданында 5,6%, Кербұлақ ауданында - 5,8% құрады. Ұлттық парктің шекарасында Басши ауылдық округінің жерлерінде үш ауылда Басшы, Нұрым, Аралтөбе және Қосбастау (ГБА - геологиялық барлау ауылы) 3270 адам тұрады бар. Қорғалатын аймақтың сыртында (буферлік аймақ) Қоңырөлең және Айдарлы елді мекендері бар. Барлық елді мекендерді сумен жабдықтау көзі - артезиан ұңғымалары және санитарлық қорғаудың алғашқы аймақтары бар бұлақтар. Елді мекендердегі сумен жабдықтау жүйесі 1967 жылдан бері жұмыс істейді, ұзындығы 8466 метр су жіберетін колонкалар - 25, оның 20-сы қолданылады.
Ұлттық биосфералық резерваттың аумағы ендік бағытта 120 км-ге, меридиандық бағытта 50-70 км-ге созылып, ауданы 460208 га құрайды, оның ішінде тұрақты жер пайдалану 263329 га құрайды. Буферлік аймақтың аумағында бірнеше ондаған адам тұрады, ал Басши ауылдық округінде жерлері даму аймағында орналасқан 3145 адам тұрады. Халықтың тығыздығы 1 адам/шаршы шақырымды құрайды. Алматы облысының аумағында Жаркент тарихи-мәдени орталығы мен Шарын мемлекеттік ұлттық паркімен көршілес орналасқан «Алтынемел» биосфералық резерватының туризмді аймақтың әлеуметтік-экономикалық дамуын жандандыратын көрсеткішке айналдыру үшін үлкен мүмкіндіктері бар. Аудан аумағы халықаралық маңызы бар автокөлік жолдарымен, оның ішінде ұлттық парктің солтүстік бөлігімен өтеді.
Алтынемел ұлттық саябағы мен оған іргелес жатқан аудандардың табиғи жағдайы әртараптандырылған ауылшаруашылығы мен туризмді дамыту үшін өте әртүрлі. Айта кету керек, Ұлы Жібек жолының қазақстандық бөлігі аймақ арқылы өтеді. Жаркент қаласында бірегей сәулет-өнер мұражайы «Жаркент мешіті» бар. Қазіргі уақытта бұл бағыт Қазақстан мен Қытай арасындағы сауда-экономикалық қатынастардағы маңызды бағыттардың бірі болып табылады. Әрине, бұл табиғи және тарихи-сәулет нысандары Қазақстанның оңтүстігінде және оңтүстік-шығысында туристік кластердің бір бөлігін құруға негіз болып табылады. Бұл кластерді Алтынемел резерватының және Жаркент қаласының мүмкіндіктері айтарлықтай толықтыра алады. Алтынемел ұлттық паркі аумағындағы туризмге келетін болсақ, мұнда тұратын тұрғындарды туристік бизнеске тарту керек. Резерват аумағындағы елді мекендер қызметтерді әртараптандыру тұрғысынан туристік компаниялардың маңызды элементтеріне айналуы керек. Мысалы, туристерді экологиялық таза өнімдермен, көлік құралдарымен (атпен саяхат), туристерді АлтынЕмел жағдайында жылдың маусымына қажетті туристік құрал-жабдықтармен қамтамасыз етуде (жалға беру орындары), қонақ үйлер мен спорттық лагерлер, кәдесыйлар жасау және сату, т.б. Ұлттық саябақтың аумағы өте жақсы күйде, еш жерде қоқыс жоқ, үнемі босатылатын қоқыс жәшігі бар. Кордондар, қонақ үйлер және басқа құрылыстардың айналалары жақсы жағдайда. Туристер тұратын жерлерде дәретханалар бар. Туристердің ұзақ тұратын орындарында (1 күннен астам) ішкі душтары мен дәретханалары бар қонақүйлер бар, кәріз жүйесі жоқ, септиктер қолданылады.
Кең ендік жоспарда Алтынемел БР-ның бүкіл аумағы шөлді аймақта, орта нағыз шөлдердің субзонасында орналасқан, сондықтан құрғақ ойпаттың, таяз және тау етегіндегі жазықтардың шөл экожүйелері басым болады. Тауларда гидротермалдық режимнің ерекше жағдайында дала, шалғын, бұта және орман экожүйелері қалыптасады, олардың ерекшелігі факторлар кешенінің өзара байланысы арқылы анықталады. Айта кету керек, Алтынемел аумағында шөлді жазықтық және тау етегі экожүйелері басым таулы аймақтарды ескере отырып, ол Іле таулы ойпатының экожүйелік түрлерінің әр түрлілігін және оны қоршайтын жоталары (Алтынемел, Дегерес, Матай және т.б.) Жоңғар Алатауының оңтүстік шығысын толығымен қамтиды, сонымен қатар Шолақ, Қатутау және бор- палеогендық таулар Ақтау таулары сияқты ерекше оқшауланған ежелгі төмен таулар массивтері бар.
Экожүйелер. Биосфералық резерваттың экожүйелері 4 негізгі класқа бөлінеді: таулы, ұсақ шоқылар, тау етектері және жазықтық. Тау және ұсақ шоқылар экожүйелері негізінен дала экожүйелерімен, сирек шалғындармен, бұталармен және орман экожүйелерімен кездеседі. Тау етектері мен жазықтардың экожүйелері негізінен шөлді, сирек сораңды жартылай гидроморфты және гидроморфты, сондай-ақ шалғынды және тоғайлы гидроморфты экожүйелер. Резерват аумағында келесі негізгі экожүйелер түрлері көрсетілген:
Таулы ағаштар мен бұталардың экожүйелері - ормандардың фрагменттері сирек кездеседі, негізінен тек Алтынемел жотасы, Дегерес және Матай тауларында болады. Бұталы бұталар барлық жерде, көбінесе құрғақ, ксерофитті.
Жабайы жеміс ағаштарының қатысуымен бұталы тоғайлар. Сиверс алмасы (Malus sieversii) мен долана қатысатын экожүйенің бөліктері өзендер бойымен Дегерес және Матай тауларының шатқалдарында анда-санда кездеседі. Сиверс алма ағашы сұрыптау үшін ең құнды материал. Жемістер әртүрлі пішіндермен, өлшемдермен және дәмімен ерекшеленеді. Алма және долана итмұрын (Rosa), бөріқарақат (Berberis), ырғай (Cotoneaster) түрлерінің бұталы баурайларында кездеседі.
Тау өзендерінің аңғарларының таулы тоғайлы экожүйелері. Өсімдіктері - жайылмалы орманды-шалғынды және шалғынды-аллювиалды топырақтардағы бұталы-талды тоғайлар (Salix, Rosa, Berberberis). Шатқалдарда кейде қызылкітаптық кавказ таудағаны (Celtis caucasica) кездеседі, ал жоңғар жібілгені (Clematis songorica) мол. Бұл экожүйелер көптеген сирек кездесетін жануарлар мен өсімдіктердің тіршілік ету ортасы болып табылады және суды реттеу мен суды қорғау үшін маңызды. Таулардың төменгі аймақтарында олар рекреация нәтижесінде өзгереді.
Аршалы немесе арша тоғайлары мен жатаған ағаштар (Juniperus pseudosabina) 1600–2400 (2800) м биіктіктегі таулы жерлерде тау далалары мен шалғындармен кезектеседі, олардың ландшафты тұрақтандырғыш және бальнеологиялық маңызы бар (фитонцидтер).
Тау шалғынды экожүйелер негізінен биік және орта тауларда (Алтынемел, Матай, Дегерес таулары), ал саябақтың ішінде сирек кездеседі.
Субальпілік шалғындар (2200-2800 м). Едәуір кең тарағандары - теңгежапырақтылар (Alchemilla vulgaris, A retropilosa) және қазтамақтар (Geranium saxatile, G. albiflorum), түрлі шөпті-астық тұқымдасты (Pleum phleoides, Alopecurus pratensis, Helictotrichon pubescens) шалғындар. Субальпілік таулы шалғынды топырақтар. Жануарлар дүниесі үшін жақсы жазғы жайылымдар, омарта үйшіктерін орналастыруға болады. Кеңейту аумағында Матай тауы (батыс бөлігі) орналасқан.
Нағыз шабындықтар (1600-2200) астық тұқымдасты-түрлі шөптесінді, кәдімгі тарғақшөп (Dactylis glomerata), жіңішке жапырақты қоңырот (Poa angustifolia) және түрлі шөптесін түрлері (Thalictrum, Ligularia, Geranium, Sanguisorba және т.б.). Олардың астындағы топырақ тау каштаны және тау қара топырағы болып табылады. Нағыз шалғындар, жақсы дамыған шым арқасында, топырақты қорғайды. Олар жабайы және үй жануарларына шабындық және жазғы-күзгі жайылым ретінде пайдаланылады.
Тау және тау бөктеріндегі далалы экожүйелер барлық биіктіктерде таралған және негізінен петрофиттік (тау жартастары мен шағылтастарда), гемипетрофиттік (қиыршық саздар мен саздақтарда) және нақты (қара топырақтарда) нұсқалардан тұрады. Саябақта келесі тип тармақтары ұсынылған:
Биік таулы дала экожүйелері - 2200-2900 м биіктіктегі таулардың оңтүстік макробеткейлерімен шектелген және термоксероморфты топырақтағы бетегелі-сұлыбас шөпті далалармен ұсынылған.
Орта таулы дала экожүйелері (1600-2400 м). Өсімдіктер құрғақ бетегелі-сұлыбас шөпті далалары бетеге (Festuca valesiaca), қылқан селеулер (Stipa capillata, S. kirghisorum), қоңырбас (Koeleria cristata), сондай-ақ әртүрлі сұлыбас-бетегелі далалар (Stipa zalesskii, Stipa capillata, S. lessingiana), бетеге (Festuca valesiaca) и сұлыбас (Нelictotrichon songorica), жиі бұталармен Rosa, Spiraea, Cotoneaster, Atraphaxis туыстары, сонымен қатар шалғынды далалар шалығындық та, далалық та түрлерден: Festuca valesiaca, Stipa zalesskii, Poa stepposa, Phleum phleoides, Dactylis glomerata, рр. Thalictrum, Hedysarum, Galium, Medicago тұрады.
Таудың каштан топырағы және таулы қара топырақтар. Топырақты сақтау экожүйелері. Жабайы және үй жануарларына арналған жазғы-күзгі жайылымдар.
Аласа таулы шөлді-дала экожүйелері биіктігі 400-600 (800) м биіктіктегі эфемероидты-жусанды-селеу далаларында Stipa sareptana, S. lessingiana, S. caucasica, Festuca valesiaca, жусан түрлерімен (Artemisia) Seriphidium туыс тармағынан және бұталар: Spiraea, Atraphaxis, Rosa туыстары басым. Ерте көктемгі флораның көптеген сирек кездесетін сәндік түрлерінің - қызғалдақтар, құртқашаштар өсетін жерлері. Тау және тау бөктері ақшыл каштан топырақтары. Саябақта тұратын жабайы тұяқтылардың барлық түрлеріне арналған көктемгі-күзгі-қысқы жайылымдар.
Тау етегі құрғақ-далалы экожүйе 1550-1700 м биіктіктегі құрғақ дала Алтынемел жотасының етегіне жақын орналасқан жазықтардың кішкене бөлігін алып жатыр. Қауымдастықта селеу шөптер (Stipa capillata, S. kirghisorum) және бетегелі (Festuca valesiaca), құрғақшылыққа төзімді шөптер, сондай-ақ жусанның (Artemisia tianschanica) және тау жусанның (Ajania fastigiata) тау түрлері басым.
Тау етегіндегі шөлейтті далалар 1400-1550 м биіктікте кең таралған. Олардың құрамында шымқабатты астық тұқымдастармен жусанның шөлді түрлері өседі. Шөлейт дала жусан-бетегелер (Festuca valesiaca, Artemisia heptapotamica) және жусан-селеу шөптері (Stipa caucasica, S. orientalis, Artemisia heptapotamica, A. sublessingiana) қауымдастықтарымен ұсынылған, олардың соңғысын орталықазиялық, жоңғар дала типі деп санаған жөн.
Шөл экожүйелері саябақтағы ең үлкен аймақты алып жатыр және әртүрлі тип тармақтарымен ұсынылған.
Таулы дала шөлдері (шөлейттер) тау етегіндегі қоңыр топырақтардағы шөлді жартылай бұталардың басым болуымен астық тұқымдастардың белсенді қатысуымен ерекшеленеді. Көбіне астық тұқымдасты-жусанды (Artemisia heptapotamica, Stipa sareptana, Agropyron cristatum) және астық тұқымдасты-көпжылдық сораңдар (Nanophyton erinaceum, Stipa caucasica, S. orientalis) қауымдастықтары кездеседі.
Нағыз шөлдер жазықтарда, үстірттерде және ұсақ шоқыларда кездеседі және осы аумақтың жалпы зоналық жағдайын анықтайды. Олар екі нұсқаға бөлінеді:
Су қоймаларының экожүйелері сұр-қоңыр топырақтардағы басым аудандарды алады. Олардың құрамында көпжылдық жартылай бұталы және бұталы көпжылдық сораңдар басым (Nanophyton erinaceum, Salsola arbusculiformis, Arthrophyton iliense, A. balchashense, A. longibracteatum, Anabasis salsa және басқалар) және жусандар (Artemisia sublessingrae, Artemisia alba).
Құм экожүйелері - шөлді құмды топырақтарда адырлы және адырлы-тізбекті бедермен және псаммофиттік өсімдіктер басым ақ сексеуіл төменгі (Haloxylon persicum, Calligonum түрлері, Krascheninnikovia ceratoides, Dendrostellera arenaria), жусандар (Artemisia santolina, A. arenaria) мен эфемерлер төменгі қабатта.
Шөлді ормандардың экожүйелері қара сексеуіл қауымдастықтары сұр-қоңыр зоналық және такыр тәрізді, кейде шақпақтасты топырақты болады. Олар Басши алқабының орталық бөлігінде Құланшоқы тауларында және Катутау тау бөктерінің оңтүстік бөлігінде (Сексеуілді бөрене) кездеседі. Қара сексеуіл (Haoxylona phyllum) шөлдердің өсімдік жамылғысының күшті түзушісі, өзі құрған қауымдастықтардағы тіршілік ету ортасын қалыптастырады, көлеңкемен, топырақтың тұздануымен, микроклиматтағы өзгерістермен, әсіресе ағаштардың тәжі астымен байланысты.
Өте құрғақ топырақтардағы шөлдер шөлді жазықтың ең төменгі бөліктерімен (700 м-ден төмен) шектелген және осы аймақтағы шөлдердің ең қызықты түрлерінің бірі болып табылады. Олардың таралуы Іле таулы ойпатының төменгі бөлігінің айтарлықтай құрғақтығы туралы куәландырады. Шөлдің бұл түрі өсімдіктерсіз, тасты су айрықтары (гаммад) басым болуымен сипатталады.
Регель ильиниясы (Iljinia regelii) – батысортаазиялық түр. су айдындарында орналасқан. Қара тығыз төселген шағылтас пен малта тастар бетінің 90% құрайды. Су айрықтары құрғақ су ағындарымен тілімденген, қосымша ылғалдылық жағдайында өсімдіктер шоғырланған. Топырақ-өсімдік жамылғысы Орта Азияның Гоби аймағындағы жағдайға ұқсас.
Жартылай гидроморфты экожүйелер теріс рельефті позицияларды алады және олардың пайда болуы ылғалдың қосымша жағдайларына байланысты, бұл негізінен атмосфералық жауын-шашынның (тақырлар) жиналуымен немесе жер асты суларының жақын болуымен (сортаң, тақыршақ) топырақтың ылғалдылық режимімен байланысты.
Гидроморфты экожүйелер ағынды жер асты суларының жақын (0,5-3,0 м) тұрақты немесе мезгіл-мезгіл беткейлік су басу жағдайында қалыптасады.
Такыр экожүйелері сазды жабық ойпаттар болып табылады, жер бетіндегі топырақ балдырларымен өсімдіктері жоқ. Олар тек оңтүстік-шығыс бөлігінде жобаланған кеңейту аумағында, Ақтау тауларының бөктерінде орналасқан.
Су басқан батпақты экожүйелер шөптесінді батпақтарда құрақ (Phragmites australis), қоғалар (Thypha angustifolia, T. minima) және қамыстар (Scirpus lacustris, S. tabernaemontanii) таяз суларда және Қапшағай су қоймасына қосылған Іле өзеннің жаңа атырауындағы батпақтар қатарындағы топырақтарда басым, саябақтың оңтүстік-шығыс кеңейген бөлігіндегі Іле өзенінің тоғайлы алқаптарымен үйлеседі.
Шалғынды жазықтықты экожүйелер негізінен саябақтың жоспарланған кеңейту аумағында таралған. Бұл батыс жағындағы Қапшағай су қоймасына жақын орналасқан және Іле өзеннің шығыс бөлігіндегі алқабына тарайтын жағалық шалғындар. Олар жер асты суларының, бұлақтардың шығуы, ойпатты жайылымдарда таралған. Едәуір аудандарда негізгі жер беті рельефінің теріс формасындағы шөпті батпақтарға қарағанда, батпақты қатардың топырақтарында қалыптасатын батпақты шалғындар кең таралған. Өсімдіктер түйнектіқамыс-құрақ (Phragmites australis, Bolboschoenus maritimus) қауымдастықтарынан тұрады. Шалғынды топырақтармен (аллювиалды-шалғынды) тегіс алқаптарда өсімдіктің жетілген сегменттері бойында нағыз шалғындардың экожүйелері қалыптасады, оларда айрауық шөптері (Сalamagrostis epigeios), мия (Glycyrrhiz auralensis) және түрлі шөптер басым. Мыңбұлақ мекенінде табиғи бұлақ маңы тоғайлары айналасында ірі шөпті ши шалғындары (Achnatherum splendens) кең таралған.
Тоғай экожүйелері (жағалау ормандары) - олар Іле өзенінің орталық бөлігінің бойында және аллювиалды шалғынды-тоғай топырақтарында Мыңбұлақ трактісінің табиғи оазисінде таралған. Бұл экожүйелердің маңызды бағыттары жоспарланған кеңейту аумағында Жаркент МБ орман шаруашылығының оңтүстік-шығыс бөлігінде орналасқан. Ағаштардың негізгі түрлері үшкір жемісті жиде (Elaeagnus oxycarpa), тораңғы (Populus diversifolia), ақ тал (Salix alba) және жоңғар талы (S. soongorica). Кеңею аймағындағы тоғайлардың ерекшелігі - Қызыл кітапқа енгізілген теректердің өзен жағасындағы құмдарда – көкшіл жапырақты тораңғы (Populus pruinosa) басым кездеседі.
Бұталардан жыңғылдардың түрлері басым (Tamarix ramosissima, T.hispida), шеңгел (Nitraria sibirica), сондай-ақ Қызыл кітапқа енген - Іле бөріқарақаты (Berberis iliensis), Іле итмұрыны (Rosa iliensis) және іле үшқаты (Lonicera iliensis).
Савваноидтық тораңғы сирек орман алқаптарының экожүйелері - теректердің тораңға туыс тармағынан (Populus pruinosa, P. diversifolia) түзілген. Ылғалдылық режиміне байланысты олар төменгі ежелгі аллювиалды жазықтарда (Мыңбұлақ мекені), үстіңгі алқаптағы террасалар мен жағалау құмдарда (Құмқала) әр түрлі бұталармен (Tamarix laxa, Reomuria songorica, Krascheninnicovia ceratoides және т.б.) тұрады. Олардың ең үлкен аудандары Жаркент орман шаруашылығы мемлекеттік мекемесінің жерлерінде шығыс бөлігінде жоспарланған кеңейту аумағында орналасқан.
Алтынемел БР флорасы бүгінде 380 туысқа және 84 тұқымдасқа жататын тамырлы өсімдіктердің 825 түрін қамтиды. Бұл тізім толық емес, өсімдіктерді, оның ішінде сулы өсімдіктерді одан әрі зерттеу қажет. Алтынемелдің флорасында Қазақстанның Қызыл кітабына енген гүлді өсімдіктердің 29 түрі бар (1981). Сирек кездесетін және құрып кету қаупі төнген түрлерден басқа, эндемиктік өсімдіктер кеңінен таралған, олар ұлттық парк аумағында және оның орналасқан жерінде ғана болады.
Омыртқасыздардың фаунасы 1658 түрден тұрады, олардың ішінде: тікқанаттылар - 56, дәуіттер және басқалары - 7, теңқанаттылар - 497, қаттықанаттылар - 536, қабыршаққанаттылар - 164, жарғаққанаттылар - 225, құс паразиттері (жәндіктер) - 1, өомекшітәрізділер - 140, ұлулар - 32 түрі.
Резерваттағы омыртқалылардың фаунасы 393 түрді құрайды, оның ішінде сүтқоректілердің 78 түрі, құстардың 260 түрі, бауырымен жорғалаушылардың 25 түрі, қосмекенділердің 4 түрі, балықтардың 26 түрі бар. Қапшағай су қоймасының және Іле өзенінің ихтиофаунасы 26 түрден тұрады. Түрлердің басым көпшілігі (88,5%) енгізілген түрлер болып табылады, олардың 39,1% -ы бағытталған акклиматизация объектілері, қалғандары су қоймасына кездейсоқ енген. Экономикалық құндылығы жағынан түрлердің 46% құнды, 12% аз құнды, 42% - кәсіптік емес. Түрлердің ең аз саны (20) су қоймасында, ең көбі (24) – Іле өзенінде байқалады. Қорықта құстардың 260 түрі тіркелген. Оның ішінде 154 түрі ұя салады (64,0%), қоныс аударатын 64 (26,6%), көшпелі 21 түр (8,7%) және ұшып келетін 2 түр (0,7%), қалғаны анықталмаған. Қазақстан Республикасының Қызыл кітабына енгізілген құстардың 28 түрі бар, олардың көпшілігі ұлттық саябақта ұя салады. Алтынемел биосфералық резерватында нағыз мекендейтін сүтқоректілердің таралу тәртібі келесідей: жәндікқоректілер - 6 түр, жарқанаттар - 11, жыртқыштар - 15, тақ тұяқты жануарлар - 3, жұп тұяқты жануарлар - 7, кеміргіштер - 26 және қоянтәрізділер - 2 түр. Сүтқоректілердің арасында акклиматталған түрлер - ондатр, түрікмен құланы, бұқар бұғысы, қайта жерсіндірілген - Пржевальск жылқысы. Іле өзені мен Қапшағай су қоймасының жағасындағы ондатр саны су деңгейінің күрт өзгеруіне байланысты аз. Сондықтан бұл сүтқоректілердің басқа түрлеріне айтарлықтай әсер етпейді. Құлан саны қазірдің өзінде 2692 бастан асты. Алтынемел аумағында сирек кездесетін және құрып кету қаупі төнген жануарлардың көптеген түрлері бар, олардың 2-сі - балық, 2-қосмекенділер, 1-бауырымен жорғалаушылар, 11 сүтқоректілер және 28 құстар.
Алтынемел мен оған іргелес жатқан аудандардың табиғи жағдайлары әртараптандырылған ауылшаруашылығы мен туризмді дамыту үшін өте әртүрлі. Сонымен қатар көршілес Ұйғыр ауданының аймағында әйгілі табиғи ескерткіштер бар - Еуразиядағы жалғыз реликті шаған тоғайы (Канададан кейінгі екінші), ауданы 5,0 мың га, Қазақстанда танымал Шарын өзенінің шатқалдары. Реликті тоғайдың пайда болуы палеоген дәуіріне жатады, бұл - үштікке дейінгі кезең аяқталғаннан бері сақталатын ерекше табиғи ескерткіш. Ескерткіштің негізін қазіргі заманғы флораның ежелгі түрлерінің бірі - ХТҚО халықаралық критерийлері бойынша жойылып кету қаупі төнген түрлерге жатқызылған соғды шағаны құрайды. Ұлы Жібек жолының қазақстандық бөлігі аймақ территориясы арқылы өтеді. Жаркент қаласында бірегей сәулет-өнер мұражайы «Жаркент мешіті» бар. Қазіргі уақытта бұл бағыт Қазақстан мен Қытай арасындағы сауда-экономикалық қатынастардағы маңызды бағыттардың бірі болып табылады. Бұл табиғи, тарихи және сәулет нысандары Қазақстанның оңтүстігі мен оңтүстік-шығысында туристік кластердің бір бөлігін құруға негіз болып табылады.
Бұл кластерді Алтынемел биосфералық резерваты мен Жаркент қаласының мүмкіндіктері айтарлықтай толықтыра алады. Біз туризмнің әртүрлі түрлері мен санаттарын ескере отырып, аймақтағы әртараптандыру туралы айтып отырмыз: экологиялық, этникалық, мәдени, ғылыми, рекреациялық, бүкіл Оңтүстік-Шығыс Қазақстанның жалпы экономикалық дамуы жағдайында.